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苹果手机的短信在正常情况下不会自行消失。如果短信自动消失，可能是由于以下几个原因造成的。
1、未保存新短信：如果在短信未保存的情况下删除或退出短信应用，可能会导致短信消失。
2、短信与某些应用冲突：如果手机中的某些应用与短信应用发生冲突，可能会导致短信消失，建议检查最近下载或更新的应用，并尝试卸载最近安装的应用来解决问题。
3、手机系统问题：如果手机系统出现BUG，也可能导致短信消失，可以尝试重启手机或更新系统来解决问题。
4、误删除：可能是自己或他人误删除了一些短信。
5、账户问题：如果使用iCloud或其他云服务备份手机，可能是同步过程中出现了问题，导致部分短信消失，可以尝试重新同步数据来恢复短信。
如果发现短信消失，可以尝试使用恢复工具找回，为了避免重要短信丢失，建议及时备份短信数据。